線蟲是一種無色的小蠕蟲，體型極小，長1毫米左右，主要危害蘑菇、香菇、黑木耳、平菇等。

可從春天出耳牙時起，用1％石灰水上清液，或5％食鹽水溶液噴灑黑木耳，并在地面上撒石灰粉即可。局部發現線蟲，要將其周圍的培養料一起挖掉，并用0.1％碘化鉀溶液噴灑。

跳蟲又叫煙灰蟲，成蟲灰色或紫色，若蟲白色，可危害多種食用菌的菌絲和子實體，在高溫潮濕條件下繁殖快，1年可發生5～7代。主要危害香菇、黑木耳、蘑菇、銀耳等。防治時可在進料前的菇床架和進料后的料面上噴灑80％敵敵畏1000倍溶液或50％辛硫磷200～500倍溶液殺蟲。床面無菇時，可噴灑0.2％樂果乳劑，或0.4％敵百蟲或敵敵畏1000倍液加少量蜜糖進行誘殺。床面出菇后發生跳蟲時，可用2.5％魚藤精乳油或20％除蟲菊醋800～1000倍液殺滅。

綠霉菌 主要危害香菇、黑木耳、銀耳、蘑菇等。初染病時，可用pH值為10的石灰水擦凈料面。菌塊上出現綠霉時，要及時用多菌靈800倍液擦洗。